Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL4P13236 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL4P13236 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL4P13236 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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