Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms