Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGAP02671 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGAP02671 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGAP02671 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms