Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSD2O96028 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms