Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms