Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms