Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WASHC1A8K0Z3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms