Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms