Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms