Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MRPS28Q9Y2Q9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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