Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FARSAQ9Y285 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms