Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms