Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX7Q9UNH6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms