Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLKQ9UBT6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms