Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms