Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms