Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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