Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms