Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C11orf49Q9H6J7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms