Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XKR8Q9H6D3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XKR8Q9H6D3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms