Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms