Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms