Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms