Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms