Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELP4Q96EB1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms