Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM3DQ96BQ1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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