Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APH1AQ96BI3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APH1AQ96BI3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms