Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms