Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms