Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms