Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms