Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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