Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A9Q8NBW4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms