Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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