Protein–RNA interactions for Protein: Q86U90

YRDC, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YRDCQ86U90 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YRDCQ86U90 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms