Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms