Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms