Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms