Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A3Q5K4L6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms