Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FREM1Q5H8C1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FREM1Q5H8C1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FREM1Q5H8C1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FREM1Q5H8C1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FREM1Q5H8C1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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