Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALFQ53S48 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms