Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NBPF1Q3BBV0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms