Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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