Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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E2F4Q16254 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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