Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFNB3Q15768 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms