Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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