Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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