Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms