Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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