Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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FOXI1Q12951 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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